利用黑曲霉的柠檬酸深层发酵工艺
柠檬酸深层发酵工艺是利用黑曲霉 (Asptrgi llus niger)菌种在一定条件下的生命代谢活动而获得产品，是属于典型的好氧发酵。黑曲霉利用糖类发酵生成柠檬酸，其生物合成途径现普遍认为是葡萄糖经酵解(EMP)和戊糖磷酸途径 (HMP)降解生成丙酮酸 (PYR), PYR一方面氧化脱狡
柠檬酸生产工艺流程
生成乙酞 (CoA)，另一方面二氧化碳固定化反应生成草酞乙酸，草酞乙酸与CoA缩合成柠檬酸。这一过程已被 Kubicek和 Rohr, Feir和 Sueuki, Woronick和 JohnsonWongchai和 Jefferson等学者研究所证实，这一反应过程中二氧化碳的固化反应有很重要的生物学意义，其一是:
其二是:(PEP)磷酸烯醇式丙酮酸在PEP催化酶的作用下梭化生成草酞乙酸，反应时如下:
根据葡萄糖生成柠檬酸的碳平衡和能量代谢过程，在乙酞 CoA和草酞乙酸缩合时还从水中吸取一个氧原子，总反应式为:
在柠檬酸的发酵过程中酵解途径在黑曲霉柠檬酸产生菌中起主要作用。